[Analysis of changes in broiler microbiome biodiversity parameters due to intake of glyphosate and probiotic Bacillus sp. GL-8 using next-generation sequencing] Анализ изменений параметров биоразнообразия микробиома бройлеров в результате приема глифосата и пробиотика Bacillus Sp. GL-8 с использованием секвенирования следующего поколения

In recent years, there have been more data that the nonselective herbicide glyphosate (GLY) can negatively impact gut bacterial communities. The aim of our study was to investigate the composition of broiler caecal microbiome under chronic exposure to GLY and the introduction of a probiotic microorganism strain into the diet. 120 broilers were divided into three groups: Group 1 of control birds fed the basic diet (BD); Group 2 of experimental birds fed BD supplemented with GLY; and Group 3 of experimental birds fed BD supplemented with GLY and a probiotic strain of the microorganism Bacillus sp. GL-8. For analysis, we used the next-generation sequencing (NGS) technique. Due to the GLY administration, there was a trend of lowering the biodiversity of normal microflora representatives, along with intestinal colonization by undesirable forms of microorganisms. In particular, when adding GLY (Group 2), we observed a decreased number of Tepidimicrobium representatives (0.001 ±0.00006%) that ferment indigestible polysaccharides, while in Group 1 their content was greater (0.3 ± 0.02%; P ≤ 0.05). In Group 3 with probiotic, there was a lower number of Firmicutes (by 16.7%) and a rise in the number of Bacteroidetes (by 19.1%) as compared to Group 2 (P ≤ 0.05).

В последние годы появилось больше данных о том, что неселективный гербицид глифосат (GLY) может негативно влиять на бактериальные сообщества кишечника. Целью нашего исследования было изучение состава микробиома слепой кишки бройлеров при хроническом воздействии GLY и введении в рацион пробиотического штамма микроорганизмов. 120 бройлеров были разделены на три группы: 1 группа – контрольная птица, получавшая основной рацион (BD); 2-я группа опытных птиц, получавших BD с добавлением GLY; 3-я группа опытных птиц, получавших BD с добавлением GLY и пробиотического штамма микроорганизма Bacillus sp. GL-8. Для анализа использован метод секвенирования следующего поколения (NGS). При введении GLY отмечена тенденция к снижению биоразнообразия представителей нормальной микрофлоры, наряду с колонизацией кишечника нежелательными формами микроорганизмов. В частности, при добавлении GLY (2-я группа) наблюдалось снижение количества представителей Tepidimicrobium (0,001±0,00006%), ферментирующих неперевариваемые полисахариды, тогда как в 1-й группе их содержание было больше (0,3±0,02%; P ≤ 0,05). В 3-й группе с пробитиком отмечено меньшее количество Firmicutes (на 16,7%) и увеличение количества Bacteroidetes (на 19,1%) по сравнению со 2-й группой (P ≤ 0,05).

Russian authors' names: Лаптев Г., Тюрина Д., Йылдырым Е., Ильина Л., Горфинкель Е., Филиппова В., Дубровин А., Меликиди В., Новикова Н., Калиткина К., Молотков В., Пономарева Е., Громов Д., Романов М.

Russian authors' affiliations: Георгий Лаптев, Дарья Тюрина, Елена Йылдырым, Лариса Ильина, Ксения Калиткина, ООО «БИОТРОФ+», Санкт-Петербургский государственный аграрный университет (ФГБОУ ВО СПбГАУ), Санкт-Петербург, Россия. Елена Горфинкель, Валентина Филиппова, Андрей Дубровин, Вероника Меликиди, Наталья Новикова, Виталий Молотков, Екатерина Пономарева, ООО «БИОТРОФ», Санкт-Петербург, Россия. Дмитрий Громов, Санкт-Петербургский государственный аграрный университет (ФГБОУ ВО СПбГАУ), Санкт-Петербург, Россия. Михаил Романов, Кентский университет, Великобритания.

(Third International Conference on Agriculture Digitalization and Organic Production (ADOP 2023): Conference Programme and Abstracts, St. Petersburg, Russia, 5–7 June 2023; p. 20 / Третья международная конференция "Цифровизация сельского хозяйства и органическое производство ADOP 2023": Программа конференции и тезисы, Санкт-Петербург, Россия, 5–7 июня 2023 г. С. 20 / Online version: Vol. 1, No. 1 (2023): III International Conference on Agriculture Digitalization and Organic Production (ADOP 2023).)